I forbindelse med oppstart av et eliteserielag i Håndball i 1997, ble Heimdal IF restrukturert og organisert som et såkalt allianseidrettslag.  

Dette medfører at hvert enkelt lag under hovedlaget er egne rettssubjekter med egne styrer og egen økonomi.  Dette ble gjort for at ikke underskudd og dårlig drift i ett lag skal påvirke økonomien i andre lag, feks ved konkurs.

I dag er  Heimdal IF Fotball, Heimdal IF Håndball og Heimdal IF Ski skilt ut fra hovedlaget som såkalte "Idrettslag organisert av allianseidrettslag"